为确保南水北调中线水源工程水质安全，对南水北调工程中线水源丹江口库区水质进行有效的监测、监督和保护，中线水源公司建设了丹江口库区水质监测站网。水质监测站网于2017年1月正式投入运行，包含中心实验室、自动监测站、移动式监测站以及信息化平台中心，另配备采样专用船和无人机等监测设备设施。
中心实验室面积约1030 m2，各功能房间近30间，配备了水环境监测仪器设备近80台（套），通过了计量检定，具备测试《地表水环境质量标准》（GB3838-2002）全部109项指标的能力，同时还具备检测水体浮游植物、浮游动物、底质、生物残毒的能力。目前，公司依托中心实验室对库内及入库支流32个断面组织开展水体、水生生物、沉积物等介质中污染物监测工作。
自动监测站包括3个固定式水质自动监测站（简称固定站）和4个浮船式水质自动监测站（简称浮船站），每4个小时对库区重点区域水样进行自动采样和监测分析。固定站可监测15项水质指标和5 项气象指标，浮船站可监测10个水质监测指标。
移动监测站包括1艘移动水质监测船和1辆移动水质监测车，用以保证库区突发状况下的水质应急监测工作。其中，移动监测车可快速监测21项水质指标，移动检测船可监测19项水质指标。
自投运以来，水质监测站网实现了对丹江口库区水源水质全面、连续、有效的监测，满足了水源地水质监控需求，圆满完成日常监测任务，有效应对多次突发情况，保障了丹江口水库水质安全。
